Derzeit arbeiten 30 Mitarbeiterinnen und Mitarbeiter am ISOE. Von ihnen sind 20 Wissenschaftlerinnen und Wissenschaftler.

Das Institut gliedert sich in sechs Forschungsschwerpunkte. Unterstützt werden die WissenschaftlerInnen durch die Bereiche Interne Dienstleistungen und Wissenskommunikation und Öffentlichkeitsarbeit. Außerdem können sie auf die Präsenzbibliothek des ISOE zugreifen. 

Hinzu kommen ein Koordinator für Strategische Beratung sowie eine Koordinatorin für Hochschulkooperation und wissenschaftlichen Nachwuchs.

Zur Institutsleitung gehören Dr. Thomas Jahn (Sprecher), Dr. Irmgard Schultz und PD Dr. Thomas Kluge. Beraten wird das Institut durch einen Wissenschaftlichen Beirat.